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解释:了解冠状病毒的丰富、高度传播的突变

Covid-19 突变:到目前为止,全球已记录了超过 3200 万例中的 12,000 个突变。已发现一种突变最为普遍。它首先在中国和德国被注意到。

RNA 病毒(如 SARS-CoV-2)变异缓慢,因为它们需要宿主(人类细胞)才能复制。 (档案照片/代表性)

冠状病毒 SARS-CoV-2 不断变异,但特别是其中一个变异因其丰富性而引起了研究人员的注意。这种名为 D614G 的突变已被发现比大多数其他突变更具传播性。







什么是 D614G 突变?

所有病毒都会发生变异以适应人类设置的障碍。 RNA 病毒(如 SARS-CoV-2)变异缓慢,因为它们需要宿主(人类细胞)才能复制。

迄今为止,全球已记录了超过 32 万例中的 12,000 个突变。已发现一种突变最为普遍。它首先在中国和德国被注意到,但在欧洲出现的几个案例中引起了人们的注意,并最终在美国、加拿大、澳大利亚和印度出现。在该突变中,甘氨酸 (G) 取代了氨基酸中第 614 位的天冬氨酸 (D)。因此,该突变被称为“D614G”。



IND614G,G(甘氨酸)在第 614 位替换 D(天冬氨酸)。 (Korberet al/Cell)

是什么让这种突变与其他突变不同?

要理解这一点,我们必须了解 SARS-CoV-2 如何进入人体细胞。发生突变的氨基酸位于病毒的刺突蛋白中。刺突蛋白与人体细胞上的 ACE2 受体结合并进入。

CSIR 基因组学和综合生物学研究所的科学家 Rajesh Pandey 博士解释说,刺突蛋白中的肽与 ACE2 受体锁定。在 D614G 突变中,三种肽中的两种打开,使进入人体细胞的机会更高。想象一下有三个手指的手。如果只打开一根手指,则拾取物体的权限有限,但如果打开两根手指,则可以拾取更多物体。这两种肽增加了病毒进入人体细胞的机会。



由于其性质比其他突变菌株更有可能进入宿主细胞,因此 D614G 具有更高的传播率。 GISAID 是一个记录了所有 SARS-CoV2 流行毒株的全球病毒数据库,表明这种突变毒株从 3 月开始在欧洲变得突出。

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这有什么影响?

病毒每次在人体细胞中复制时都会发生变异以适应和生存。这种突变正在帮助病毒做到这一点。 GISAID 的数据显示,直到 3 月初,这种突变还很罕见,但在欧洲占据了主导地位。

Cell 的一篇论文观察到:2020 年 3 月 1 日之前,它(D614G)在 997 个全局序列中的 10% 中被发现; 2020 年 3 月 1 日至 31 日期间,它占 14,951 个序列的 67%;在 2020 年 4 月 1 日至 5 月 18 日期间,它占 12,194 个序列的 78%。



Medrxiv 上的一篇预印本论文发现,感染这种突变的患者在初步诊断时鼻咽部的病毒载量明显更高。该研究对休斯顿 5,085 种 SARS-CoV-2 毒株的基因组进行了测序。

由于它很容易进入细胞,这种菌株已经生长并传播得很快。孟买 Kasturba 实验室的微生物学家 Jayanthi Shastri 博士说,这就是它大肆宣传的原因。 Shastri 说,初步研究表明 D614G 可能导致更多的传播和严重的症状。她说,最初我们确实看到了严重的传染性,但随着时间的推移,在我们的样本中发现传染性不能与突变直接相关,其他共病因素也起作用。到目前为止,没有足够的纵向研究在 D614G 与死亡率增加之间建立直接联系。 Shastri 说,为此我们需要对几名重症患者进行基因组测序,以检查是否存在这种突变。



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它在印度流行吗?

《柳叶刀》在孟买的四名卫生工作者中发表了 Covid-19 再感染的预印本。卡斯图巴医院、国际基因工程与生物技术中心和CSIR-基因组学与综合生物学研究所的研究发现其中三个存在D614G突变。在一名第二次再次感染的医生中,存在 D614G 突变。他出现了严重的症状,需要进行血浆治疗。但我们不能确定将 D614G 与感染的严重程度直接联系起来,Shastri 说。



在另一位医生中,D614G 存在于第一次感染中,但并未导致严重症状。

这种突变是否会导致死亡,或者是否可以通过疫苗来解决尚不完全清楚。一些研究表明它不会导致肺部严重感染。

它是疫苗接种目标吗?

它的丰富性为研究人员提供了研究和瞄准其机制的机会。辉瑞正在研究一种候选疫苗,其中抗体将阻断病毒中的受体结合域。该疫苗在德国的试验显示出针对 D614G 菌株的有希望的结果。

9 月 2 日在 Biorxiv 上发表的一篇预印本乐观地认为,这种突变可能不会降低疫苗对其的有效性。

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