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新研究:确定可对抗所有冠状病毒的药物的潜在靶点

药物通常结合在紧贴药物的蛋白质口袋内,从而干扰蛋白质的功能。科学家可以从病毒蛋白的 3D 结构中识别出潜在的药物结合口袋。

他们在美国化学学会的蛋白质组研究杂志上报告了他们的发现。

可能出现具有疫苗抗性的 SARS-CoV-2 变体以及新型冠状病毒,这使得找到对所有冠状病毒有效的治疗方法变得非常重要。







现在,研究人员分析了 27 种冠状病毒的病毒蛋白和来自 Covid-19 患者的数千个样本,确定了可以成为最佳药物靶点的高度保守的序列。他们在美国化学学会的蛋白质组研究杂志上报告了他们的发现。

药物通常结合在紧贴药物的蛋白质口袋内,从而干扰蛋白质的功能。科学家可以从病毒蛋白的 3D 结构中识别出潜在的药物结合口袋。然而,随着时间的推移,病毒可以改变它们的蛋白质口袋,从而使药物不再适合。



但是一些药物结合口袋对蛋白质的功能非常重要,以至于它们不能突变,而且这些序列在同一病毒和相关病毒中通常会随着时间的推移而保守。

美国化学学会表示,在这项研究中,研究人员 Matthieu Schapira 及其同事希望在来自 Covid-19 患者样本和其他冠状病毒的病毒蛋白中找到最高度保守的药物结合口袋,从而揭示泛冠状病毒药物最有希望的靶点在有关该研究的新闻稿中。



该团队使用计算机算法来识别 15 种 SARS-CoV-2 蛋白的 3D 结构中的药物结合口袋。研究人员随后在 27 种冠状病毒中发现了相应的蛋白质,并比较了它们在药物结合袋中的序列。

两个最保守的药物位点涉及参与病毒 RNA 复制和转录的蛋白质(分别称为 nsp13 和 nsp12)。



研究人员表示,针对蛋白质 nsp12 催化位点的新型抗病毒药物目前正处于 Covid-19 的 II 期和 III 期临床试验中,而 nsp13 的 RNA 结合位点是以前未充分探索的靶点,应该是药物开发的重中之重.

资料来源:美国化学学会



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