解释：印度有哪些 Covid-19 变种，它们是否解释了激增？
在旁遮普省发现超过 320 个冠状病毒样本具有英国血统。这是否解释了最近的激增？除了印度的其他变种外，南非和巴西变种的传播范围如何？
在浦那的一家购物中心（快递照片：Ashish Kale，文件） 来自旁遮普邦的 320 多个冠状病毒样本被发现具有 英国血统 ，指的是去年 12 月在英国出现的一种新病毒株，其基因突变使其能够更快地传播。这是迄今为止在印度人群中发现的最普遍的英国变种，可能可以解释过去几周旁遮普邦病例的迅速激增。
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周三的一份政府声明说，迄今为止，来自全国各地的 736 个样本被发现具有英国血统。除此之外，还发现34个样本具有南非血统，1个具有巴西血统。南非和巴西的变种是世界各地流行的另外两种主要的冠状病毒株。这两种变体的基因突变使它们更有可能逃脱人类免疫系统。因此，令人担忧的是，目前的疫苗可能对它们的效果相对较差，尽管这仍在调查中。
印度的变体
英国、巴西和南非的变种并不是目前在印度人群中传播的唯一变种。与任何其他生物体一样，冠状病毒也在不断变异，在每个复制周期中其基因结构都会发生一些变化。这些突变中的大多数都是无关紧要的，不会改变冠状病毒的整体性质或行为。但是其中的一些，可能是千分之一，可以带来重要的变化，帮助病毒更好地适应或生存。
在这次疫情中，三种变化正在被密切关注——一种是增加病毒传播能力的，一种是使感染者病情加重的，另一种是帮助病毒逃避免疫反应的。
英国、巴西和南非的变种就是这样的菌株。它们中的每一个现在都有自己的家族，这意味着这些家族中有许多后续的突变，但最初的定义突变保持完整。这三个变异家族或谱系已在多个国家发现，主要是造成欧洲和巴西病例激增的原因。
除此之外，还有其他几种变种在印度人群中流行，这些变种具有 起源于当地 以及由国外游客带来的其他物品。但这些都没有被归类为关注的变体。
在印度检测到的 Covid-19 变种 英国 Covid-19 变体和关注点
科学家们坚持认为，英国、巴西或南非这三个“令人担忧的变体”中没有一个与印度目前的病例增加有关。到目前为止，它们在社区中的流行程度还没有高到可以归因于当前的激增。
即使在旁遮普省，分析的 400 个样本中有 80% 被证明是英国的变种，但现在将其归咎于过去几周病例的异常增加还为时过早。基因组测序的结果现已揭晓，需要进行临床相关性评估，以评估它们是否是病例增加的原因。
正如科学家所指出的那样，如果旁遮普省感染英国毒株的人都是旅行者，或者是他们的直接接触者，那么他们的发生就很容易解释了，不必太担心。但是，如果它也在更广泛社区的人们中发现，那么它就有很快传播给其他人的危险。这也意味着该州正在遵循的隔离和检疫程序，尤其是对旅行者而言，并未得到严格遵守。
在英国菌株中发现的一些特定突变，例如一种名为 E484Q 的突变和另一种称为 N440K 的突变，也在其他一些变体中发现，并且这些突变已经在印度人群中传播了几个月。目前，没有证据表明其中任何一个都可能导致第二次激增，或导致患者再次感染。
然而，需要进行更详细的科学调查来评估它们对印度疾病传播的影响。
基因组测序…
印度是疫情期间感染冠状病毒人数第二多的国家。但它对流通中的不同变体的基因组序列进行的很少。根据政府上周在议会发表的声明，到目前为止，它已经对来自全国各地的 19,092 个样本进行了基因分析。这包括自政府于 12 月专门为此目的成立 INSACOG（印度 SARS-CoV2 基因组学联盟）以来对 10,787 个样本的测序。包括美国和中国在内的许多其他国家已经分析了超过 100,000 个基因序列。
研究生物体的基因变化是了解病毒起源、传播和对患者影响的重要线索。 INSACOG 的既定目标是通过由十个实验室组成的网络对至少 5% 的所有感染病例的样本进行测序。这现在看起来是一个非常高的要求。迄今为止，印度已记录了超过 117 万例阳性病例。迄今为止已测序的 19,092 个样本仅占该数字的 0.16%。
......以及为什么它很慢
基因组测序进展缓慢的主要原因之一是缺乏资金。到目前为止，尚未为 INSACOG 拨款，但官员们表示，现在预计任何一天都会批准资金。实验室一直在使用自己年度预算中的资金进行测序工作。提取一个样本的基因序列需要 3,000 至 5,000 卢比。成本主要是过程中所需的化学试剂。
此外，各州并未主动将样本送到实验室进行测序。根据议会提交的政府数据，马哈拉施特拉邦迄今已记录了超过 250 万例感染病例，但仅发送了约 2,800 个样本进行测序。这仅占所有案例的 0.11% 左右。喀拉拉邦送来的测序样本数量最多，约为5200个，但病例数相当的卡纳塔克邦仅送出137个样本。如此低的基因组测序率在得出关于病毒性质和行为变化的结论或设计适当的干预措施以遏制流行病的传播方面可能没有统计学意义。
本文于 2021 年 3 月 25 日首次出现在印刷版中，标题为“破解病毒株”。
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